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Coronavirus et espèces animales

Coronavirus pathogènes pour différentes espèces animales

De nombreux coronavirus non pathogènes pour l'homme le sont dans différentes espèces animales

De nombreux coronavirus touchent les espèces animales. Ils ont généralement un tropisme digestif et/ou respiratoire mais ne sont pas pathogènes pour l'homme.

Le SARS-CoV2 est un Betacoronavirus, appartenant au sous-genre Sarbecovirus

Les coronavirus suivants n'ont aucune relation avec le SARS-CoV2 responsable du Covid19 humain

  • tout d'abord les coronavirus identifiés chez nos animaux domestiques, qui n'ont aucun rôle zoonotique, donc pas de transmission à l'homme. Ils ne présentent aucun danger pour l'homme
    • Alphacoronavirus: coronavirus entérique/virus de la péritonite infectieuse féline du chat ; coronavirus entérique/pantropique du chien, virus de la gastro-entérite du porcelet, virus de la diarrhée épidémique porcine
    • Betacoronavirus
      • Embecovirus : le coronavirus entérique bovin, le coronavirus entérique équin, le coronavirus hémagglutinant de l'encéphalomyélite porcine (porcine hemagglutinating encephalomyelitis virus, responsable de la vomiting and wasting disease) et le coronavirus respiratoire canin
    • Gammacoronavirus: virus de la bronchite infectieuse aviaire
    • Deltacoronavirus: deltacoronavirus porcin.
  • Ensuite chez l'homme : quatre virus impliqués dans le rhume (signes respiratoires supérieurs)
    • Alphacoronavirus: HCoV 229E et HCoV NL63
    • Betacoronavirus: HCoV OC43 et HCoV HKU1

Aucun de ces virus humains ne présente de parenté avec le SARS-CoV2.

(information issue de https://www.formavet.be/coronavirus-31-03-2020/)

 

Revues sur les coronavirus

Risques de Covid-19 chez les animaux domestiques et de la faune sauvage : Implications pour la santé publique

Coronavirus: Des virus présents de longue date dans le monde animal

Coronavirus Aviaire

Coronavirus Bovin

Coronavirus chez les Furets

Coronavirus Canin

  • Coronavirose entérique du chien (CCoV)

Coronavirus chez les Chauves souris

- Cette étude explore la présence de coronavirus dans la faune sauvage des forêts tropicales humides d’Afrique centrale caractérise la diversité génétique de ces virus et détermine leur proximité phylogénétique avec les coronavirus humains. Elle a mis en évidence une grande variété de coronavirus chez trois espèces de chauves-souris insectivores nichant dans plusieurs grottes du Gabon, en Afrique centrale. Des chauves-souris insectivores appartenant à trois espèces (Hipposideros gigas, Hipposideros cf. ruber et Miniopterus inflatus) se sont avérées infectées par des coronavirus. Ces chiroptères abritent trois types de coronavirus appartenant aux deux groupes Alphacoronavirus et Betacoronavirus auxquels appartiennent également les sept virus infectant l’homme dont le SARS-CoV-2. En raison du potentiel zoonotique élevé des coronavirus, ces résultats soulèvent inévitablement la question du risque des transferts inter-espèces de ces virus et, in fine, celle d’une transmission à l’Homme et l’apparition d’une nouvelle épidémie, cette fois-ci à partir de chauves-souris d’Afrique.
Maganga el al. Genetic diversity and ecology of coronaviruses hosted by cavedwelling bats in Gabon

- Une étude portant sur les coronavirus hébergés chez les chéiroptères du sud et sud-ouest de la Chine établi 630 séquences génomiques partielles (440 nt dans la région RdRp, la plus conservée du génome), doublant ainsi le nombre de séquences disponibles. Les reconstructions phylogénétiques réalisées sur 701 séquences d'a-coronavirus issues de 41 espèces de chauves-souris, et 528 séquences de ß-coronavirus issues de 31 espèces, apportent plusieurs informations intéressantes. Rappelons que le virus Sars-CoV2 est un ßCov, et qu'un a-CoV fut responsable de foyers épidémiques de Sads (Swine acute diarrhea syndrom) dans les années récentes*. Des chauves-souris appartenant aux genres Rhinolophidae seraient les hôtes ancestraux majeurs des coronavirus présents en Asie. Les espèces étudiées se distribuent en 16 genres, dont la majorité (10/16) sont infectés à la fois par des a-CoV et des ß-CoV. A l'échelle de l'évolution, les événements de saut d'espèce interfamiliaux peuvent impliquer des taxa éloignés, et apparaissent plus fréquents chez les a-CoV, pour lesquels l'éloignement phylogénétique entre hôtes exercerait donc une contrainte moins forte que pour les ß-CoV. A l'échelon du genre, une fréquence similaire s'observe, avec une vingtaine de sauts d'espèce intra-familiaux prédits. En conclusion, cette étude, la plus exhaustive à ce jour, indique que les coronavirus, et particulièrement les a-CoV, ont une propension au changement d'hôte y compris au sein de leurs réservoirs naturels. (Commentaires de H. Laude, BAVF 2020)
Lattine et al. Origin and cross-species transmission of bat coronaviruses in China

 

Coronavirus Cunicole

 

Coronavirus Equin

 

Coronavirus de la Faune Sauvage

 

Coronavirus Félin

 

Coronavirus murin

 

Coronavirus Ovin et Caprin

Coronavirus Porcin

Coronavirus chez les Primates non-humains

 

Thérapies contre les coronaviroses animales

Animaux suspectés d'être à l'Origine du Covid-19

Le pangolin

Les chauves souris

Le chien viverin

Hypothèses sur les origines du Covid-19